省以下各级财政部门应于５月１日和６月１日分别将发行款项的４０％和６０％直接汇至省级财政部门指定的收款帐户。省级财政部门最迟应于５月１０日和６月１０日前按发行总量的４０％和６０％的比例，将发行款项统一缴入省级人民银行。
省级人民银行收到二年期国库券款项后，应在“代收个人购买国库券款项”科目内核算，并通过微机联网上划总行国库司（深圳经济特区分行亦与总行直接联网），联网代号为“３１４”。
２．款项上划的帐务处理
由于两年期国库券的上划款项包括现金购买、“以旧换新”及“以旧换新”中利息部分与兑付周转金的结算问题，现就上划款项的帐务处理与计算公式明确如下：
（１）截止４月底应缴款金额＝指标数（承销额）×４０％－“以旧换新”旧
券本息之和
（２）截止５月底应缴款金额＝指标数（承销额）－累计“以旧换新”旧券本
息之和－４月底已划款额
对因特殊情况未全额完成发行任务的，其截止５月底应缴款金额还应扣除未完成任务数。
按上述公式计算后，发行终了，承销单位除按应缴款金额缴纳发行款外，还应在规定的时间内将同级财政部门预拨的兑付周转金如数交回；财政部拨付各省、自治区、直辖市、计划单列市财政厅（局）的“以旧换新”兑付周转金应全额留存，继续用于７月１日后的正常兑付，因为以旧换新的利息部分均已在各自上划的发行款中作了全额扣除。
３．“以旧换新”券面的管理
承销单位在按上述规定分二次缴纳承销款的同时，应将“以旧换新”的旧券清点整理后，送承销合同甲方核查、封存。“以旧换新”工作结束后，各级财政部门应将旧券逐级上交省、自治区、直辖市财政厅（局）（计划单列市亦应上交本省财政厅）封存，待财政部下达销毁通知后，于７月１日前销毁。
六、发行费分配比例及拨付办法
二年期国库券的发行费率为发行额的５‰，其分配比例为：人民银行０．１‰，其中总行、省分行各０．５５‰；财政部０．０５‰；其余４．８５‰由财政部统一拨至各省、自治区、直辖市、计划单列市财政厅（局），由其统一支付，支付原则是：
１．具体经办单位的发行手续费率不得低于４．４‰，其中承销单位与代销单位发行手续费的具体比例，由省级财政厅（局）根据本地情况确定。
２．省以下凡委托人民银行调券的，可由省级财政部门根据调运的数额和区域向计划单列市及地（市）分行、县支行支付一定的费用，其费用率分别不得高于调运券面额的０．１‰。
３．各级财政部门发行费的分配比例不得高于：省财政厅（局）０．０５‰，地（包括计划单列市）、县财政局各０．１‰。
