（１）审查专用基金工程支出，是否按批准计划进行，资金来源是否正当。
（２）审查工程成本，计算是否正确；竣工后剩余材料是否办理退料手续，冲减工程成本。
（３）审查工程项目，是否按质按期竣工，交付使用是否办理手续；构成固定资产的项目，是否及时入帐。
（４）审查专用基金材料，采购、验收、领用、保管制度，是否健全，帐物是否相符，有无积压变质损失浪费情况。
９．专用拨款和专用借款审计
（１）审查物资开发基金、科研基金等专用拨款和专用借款，使用效果如何，是否按照指定的用途使用，有无挪作他用的情况。
（２）审查归还专用借款的资金是否合规。
１０．专用基金往来审计
（１）审查专用基金应收款项，是否合理，有无长期应收未收的情况。
（２）审查专用基金应付款项，是否正常，有无截留隐匿各项业务收入和专用基金存款利息等情况。
十、基本建设审计
１．重点建设项目审计
（１）列入国家、部门、地方的重点项目，是否进行了可行性研究和技术经济评估；《项目建议书》、《设计任务书》、《立项报告》、《初步设计》、《项目概算书》、《开工报告》等是否依照规定程序办理审批手续。
（２）审查基本建设投资计划执行情况，有无违反规定搞计划外建设项目，有无擅自扩大建设内容，增加建筑面积，提高建筑标准，超过批准的项目概预算。
（３）审查建设项目概预算有无预留投资缺口或多算投资，以及漏项、重项、数字不实的情况；审查施工图预算有无超过批准的设计总概算，施工单位取费标准是否合规合理；审查投资包干、招标投标工程的合同是否合规，有无“名包实不包”，敞口花钱的现象。
（４）审查实际发生的各个工程项目内容与批准的项目概预算是否相符，有无盲目采购造成积压的现象，因工程设计变更，材料代用而发生的材料价差、预算变更等签证手续是否完备。
（５）审查基本建设资金的管理和使用情况，有无挪作他用。
（６）审查基本建设财务会计报表，审查应付应收帐款、库存设备材料等帐帐、帐实是否相符；审查应核销其他支出中器材非常损失，设备盘亏毁损等是否真实、确切；审查结余资金、其他收入等是否列帐。
（７）审查已竣工项目的投资效果是否能达到预期的生产经营能力，是否能如期收回投资。
