近交系动物遗传品质的变异主要有３方面的因素。
（１）遗传污染；
（２）遗传飘变；
（３）遗传突变；
在这３方面中遗传污染最大，而另两方面，在一定时间内发生改变的频率很低。因此在位点选择上，根据现有常用的１０种近交系小鼠选择了位于７条染色体上８个差异性位点，作为检查的第一线位点。如果任何一种品系发生过遗传污染，这８个位点中某些位点将会出现杂合或者变异。考虑到位点的选择尽量分布在多个染色体上，再选择位于５条染色体上的五个比较容易操作，耗资较少的位点作为第二线位点的检查。大鼠选择７个位点进行检查，作为第一线位点。原则上，第一线位点的检查如果发现了问题，将不再进行第二线位点检查。
第一线位点：
Ｈｂｂ，Ｃａｒ－２，Ｇｐｄ－１，Ｅｓ－３，Ｔｒｆ，Ｇｐｉ，Ｉｄｈ－１。
第二线位点：
Ｐｇｍ－１，Ｅｓ－１０，Ｓｅｐ－１，Ｇｏｔ—２。
３．动物的选择
近交系大鼠、小鼠每个品系至少进行四只动物异体皮肤移植。皮肤移植成功者还需从核心群中选送四只动物（２♂，２♀）进行生化位点的检查。皮肤移植失败者，则不考虑进行生化位点的检查。（见附表１、２）。
第九条 医学实验动物微生物控制标准：
一级：普通动物，即要求排除人畜共患病的病原体；
二级：清洁动物，要求排除人畜共患病及动物的主要传染病的病原体；
三级：无特殊病原体（ＳＰＦ）动物，要求达到二级标准外，还应排除一些病原体。
四级：无菌动物，排除非植入的一切生命体。
一、实验动物病原菌检测等级标准（见附表５）
二、实验动物病毒检测等级标准（见附表３、４）
三、实验动物寄生虫检测等级标准（见附表６）
实验动物病理检查标准：
一级：普通动物
外观：毛色光滑清洁，贴身；活泼，行动无异常；头脸不肿；背不穹起；四肢、尾和皮肤无缺损；不喘，鼻无分泌物；肛门清洁。
病理解剖：肝、脾、淋巴结不肿大；肺、肝、脾、肾无肉眼可见不应有的病灶。
二级：清洁动物
具有一级普通动物的指标，显微镜检查没有二级微生物病原的病变。
三级：无特殊病原体动物
具有一级普通动物指标和无二和三级动物的微生物病原的病变。
四级：无菌动物
除具有一级指标外，不含有二和三级动物微生物病原的病变；脾、淋巴结等脏器具有无菌动物的组织学结构。
有关遗传突变，免疫缺损等动物可根据各个品系特征的规定检查。
第四章 医学实验动物条件设施检定标准
第十条 实验动物及动物实验设施的标准
是以确保实验动物遗传特性，微生物控制标准的相对稳定和实验结果科学水平为目的。
第十一条 实验动物设施应有的结构：
一、前区，包括：隔离检疫室、库房、办公室、饲料库、维修室和走廊。
二、控制区（饲育区），包括：育种室、种群扩大室、繁殖室、待发室、清洁物品贮藏室、饲料制作室和清洁走廊。
三、后勤区，包括：洗刷消毒间、废弃物品存放、处理间、污物走廊等。
第十二条 实验动物及动物实验设施的要求
一、普通动物（通常动物）
１．外环境条件
（１）院容整齐、清洁、定期消毒；
（２）有一定的绿化面积；
（３）设有专用的垃圾、动物尸体的存放处和尸体解剖间，动物尸体须在２４小时内焚烧或按有关规定处理；
（４）动物室附近不得饲养非实验用的家禽、家畜。
２．动物室建筑条件：
（１）要达到一定的建筑标准；
（２）中小型动物饲养室进出口不得直接对外，应有缓冲间；
（３）有防昆虫的纱门纱窗；
（４）天花板光洁、能消毒；
（５）地面平坦，地面及墙壁能洗刷；
（６）要有自来水和封闭式的下水道（防止野鼠窜入）；
（７）要有换气装置及防野鼠的设备。
３．饲养室内环境条件：
（１）室温年温差应在１８度至２９度之间（大、小鼠、豚鼠，地鼠等）
（２）相对温度６０％±２０％；
（３）空气中氨的含量应低于２０ppm：
（４）室内噪声６０分贝以下；
（５）饲养室内要整洁，无杂物、污物、无昆虫等。
４．笼、饲具条件
