领域和主题项目经费按预算分季度拨款。专题和课题经费按合同、协议或委托任务书规定的项目进度拨款。对提前完成阶段任务的专题和课题，可提前拨给下一阶段经费；对未按期完成计划任务的，须经上一级批准调整计划，修改合同、协议或委托任务书后，才能继续拨款。
领域之间的经费一般不互相调剂，年度经费如有必要调整时，需经科委审批。在同一个领域内的年度经费调整，跨主题项目的，由专家委员会审批；跨专题项目的，由专家组审批；跨课题项目的，由专题组审批，报专家组备案。
一万至五万元（含五万元）的仪器设备购置和５０平米（含５０平米）以内的实验室改装的经费，在预算额度内进行调整时，由专家组批准，报专家委员会备案；五万元以上的设备购置、５０平米以上的实验室改装，由主题项目专家组审核，报领域专家委员会批准。
项目因故终止，立即回收所余经费；对已购置物资，由专家委员会（组）负责清查处理，所获经费上交科委，用于“八六三计划”调整，物资设备由科委负责调配。
七、经费的结余
“八六三计划”年度结余经费，可结转下一年度使用，冲抵下年度预算拨款。
已完成的课题结余经费，应在课题任务完成后两月内连同课题决算表一同上交专题组，用于专题计划调整；已完成的专题结余经费，应在专题完成后一个月内连同专题决算表逐级上交到科委，作为“八六三计划”调整费。
八、非贸易外汇管理
（一）计划编报审批
根据财政部有关非贸易外汇集中控制，实行统一申请用汇，统一结算的要求和科委下达的非贸易外汇控制数，逐级编审上报国际合作、专家活动和出国的非贸易外汇使用计划（表八至表十一），报科委审批。
（二）非贸易外汇的主要开支范围
１．国际合作费，包括试验费、资料及在国外的办公费、国外劳务费及其他费用。
（１）试验费包括试验用材料、燃料、试剂费，软件、小型样品、关键零部件购置费，少量合作投资（实验室、厂房）费，设备补偿费及其他研究经费；
（２）资料及在国外的办公费包括图书资料费，在国外期间办公、水电、邮电、设备维修保养及办公家具等所需费用；
（３）国外劳务费系指在国外聘用人员所需工资、生活补助及其他劳务费用；
（４）其他费用系指执行项目计划的出国人员的生活费等费用。
