在“国家专项存款”科目下，为供销社棉花购销企业开设“棉花财政补贴”存款专户，并设立“国家储备棉利息费用补贴”、“收购棉花价差及其利息补贴”、“销售新疆棉定额补贴”、“出口棉花亏损补贴”、“以出顶进棉花亏损补贴”、“９８年度商品棉花竞卖亏损补贴”明细账，用于反映棉花财政补贴资金的拨付情况。
第四章 财政补贴资金管理的职责
第十条 财政补贴资金管理工作实行行长负责制。行长要负总责，主管行长要具体负责。
第十一条 农发行内部各业务部门要明确职责分工，密切配合，共同做好财政补贴资金管理工作。
（一）资金计划部门的主要职责
１．负责财政补贴资金的综合管理工作；
２．负责同财政等部门联系协调，及时沟通情况，协调有关问题，研究制定政策措施，督促各项财政补贴资金及时足额存拨；
３．负责审核各项财政补贴资金拨付和使用的合规性；
４．负责综合监测、分析、反映各项财政补贴资金拨付使用情况；基层计划信贷人员负责登记台账和填报财政补贴资金统计报表；
５．负责系统内上下级行之间财政补贴资金有关信息的传递与交流，协调行内各有关部门的财政补贴资金管理工作；
６．负责组织财政补贴资金管理培训，开展财政补贴资金管理方面的内部检查和调查研究工作，提出加强财政补贴资金管理的对策措施。
（二）信贷部门的主要职责
１．负责对进入企业主管部门或企业相应存款账户的各项财政补贴资金的分解，及时通知会计部门进行账务处理；
２．负责提供企业购、销、调、存情况和贷款占用形态，按月测算并提供本辖区各项财政补贴资金的应补贴数额；
３．负责会审财政补贴资金统计报表的相关内容。
（三）会计（柜台）部门的主要职责
１．负责财政补贴资金专户的开设、管理，做好柜面监督；
２．负责办理各项财政补贴资金的拨付手续；
３．负责收贷、收息、拨费的账务处理；
４．负责会审财政补贴资金统计报表的相关内容。
（四）信息电脑部门的主要职责
负责财政补贴资金统计报表（台账）软件的安装、系统维护，对使用报表（台账）软件的辅导和培训，解决报表填制上报过程中的各种技术问题。
第十二条 设置“财政补贴资金管理岗”，配备专人（兼职）负责此项工作。财政补贴资金专管员是财政补贴资金管理工作的具体执行者，其主要职责包括：
