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六、对出料加工业务中复进口的料、件，如用于进料加工业务，则应按进料加工有关规定给予减免税，其减免部分应予征收手续费。
七、对技术改造项目下引进的先进技术的软件，如设计、工艺、诀窍、数据、方法、研究成果等技术资料，按规定可享受免税，但应予征收手续费；至于设计图纸、印刷的说明书等，在《海关进出口税则》上规定免税，则可免予征收手续费。
八、对展览会的进口物资，国内单位留购如予以减免税优惠时，应予征收手续费；对外商赠送留在国内的准予减免税的展品，也应予征收手续费。
九、《办法》第五条（三）款所指的“外国团体和个人”包括外籍华人、华侨、港澳同胞，对其赠送的礼品可免予征收手续费；本款所提公益事业的范围，是指捐赠进口物品用于举办学校、医院、幼儿园、少年宫、敬老院以及建设农村引用水设施、修筑公路、挢梁等福利事业。
十、对于民政部门所属的残废人工厂经批准进口的减免税货物，免予征收手续费。
十一、《办法》第八条规定的逾期不缴手续费，应按日征收手续费总额千分之一的滞纳金，其收取滞纳金的起征点也为人民币十元，十元以下免予征收。
十二、《办法》第六条（二）款规定：“进口减税货物按照实际减除税负部分的货物的到岸价格的千分之三计征”。现将减税货物计征手续费的公式列明如下：
批准的减税税率
手续费金额＝货物到岸价格×（１－＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿）×手续费率
法定税率
十三、关于进口货物的关税和进口调节税都有减免税时，如何计征手续费问题。这种情况可以采取综合计算方法，如进口小汽车，特准免征进口调节税，关税税率减按５０％计征，按照《海关进出口税则》规定，小汽车的进口关税和进口调节税税率合计为２００％，实际应按免除税负四分之三计征手续费，其计算公式应为：
批准的关税减税税率＋
调节税减免税税率
手续费金额＝货物到岸价格×（１－＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿）×手续费率
进口关税税率＋进
口调节税税率
十四、对进口时尚不能确定储存期的保税转口货物，可在货物进口时予先征收与手续费等值的保证金，如仓储期在三十天以下即转运复出口，可退还保证金，否则即转为手续费。
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