第二部分是“政策性支持、调节费”，约占总调节费的三分之二，按照经费为科技政策服务的原则，这部分经费集中用于推动科技体制改革和当前科技事业发展迫切需要开展的工作，不宜撒芝麻。这笔经费的使用政策，由委常务会讨论决定。
第四条 一般性调节费的申请、批准程序：
１．来自国务院各部门提出的申请、本委领导批示的申请、委内有关厅司提出并经过主管该厅司的委主任批示的申请，由条件财务司汇总平衡。在经费能够平衡时，将平衡后的初步方案报请主管财务的委主任审批，同时抄报其他委主任阅知。上述工作每年分两次汇总、平衡和审批（一般在五月中旬和九月底）。
２．遇有虽然符合上述第三条支持条件，但申请经费数额较大难以平衡，或对能否给予支持，一时尚难确定时，条件财务司在综合汇总的基础上，报请主管财务的委主任，并提请委常务会议讨论决定。
第五条 政策性支持、调节费的确定、批准程序：
１．此项经费集中用于科技体制改革和促进科技事业发展有重大影响的几项工作。
２．条件财务司于每年四月底前根据推动科技改革进展和科技事业发展的有关需要，酝酿对当年政策性动手、调节费安排设想，提出几种可供委领导参考的初步安排方案，报主管财务工作的委主任审核，并由产管财务的委主任在委常务会上提出当年政策性支持、调节费的安排方案，由委常务会讨论确定当年此项经费的投向和安排方案。每年五月中旬和九月底分两次平衡、审批。
第六条 科学事业费调节费的开支范围及财务管理
１．根据实际情况分别采用拨款、有偿（含借款）和部分有偿的原则安排使用科学事业费调节费。
２．根据现行财政体制确定的中央、地方分灶吃饭的原则，科学事业费调节费应主要用于各部门科研单位，不宜用于地方的科研单位或科技工作。但对那些全国和全社会需要，又拟由地方科技部门开展的有较大影响的科技工作，可给予适当资助。
３．科学事业费调节费是国家科委用于调节科技工作部署，为科技改革和科技发展服务的经费，也是科学事业费的组成部分。按照财政部等部门颁发的《基本建设投资与行政事业费划分的规定》及其它有关事业费财务管理的规定，科学事业费调节费不得用于下列支出：
１）基本建设支出；
２）国家机关为行使其政府职能的行政性支出；
