四、上海交通大学和上海第二医科大学合并后组建的上海交通大学医学院暂保留原上海第二医科大学行政级别。上海交通大学医学院党政正副职领导干部任免，暂由上海市委在征求教育部党组意见后任免。上海交通大学医学院的主要党政领导干部应担任上海交通大学领导班子的副职，由教育部党组征求上海市委意见后任免。
五、原上海第二医科大学的附属医院为上海交通大学医学院附属医院。该医学院附属医院的行政级别、干部任免、资产隶属、经费预算和行业管理关系等，维持现状不变。
六、上海交通大学医学院暂为地方部门预算单位，现有上海市财政拨款渠道不变。上海市按原上海第二医科大学经常性经费基数拨付事业经费，并力争每年有所增长；教育部根据财力状况，争取每年有增量投入。教育部和上海市将继续给予上海交通大学医学院“211工程”建设专项资金投入支持。上海交通大学应将上海交通大学医学院的建设纳入学校统一的发展规划，在“985工程”建设资金和其他增量资金的使用安排中，予以统筹考虑。
七、教育部、上海市人民政府共同成立上海交通大学与上海第二医科大学合并工作领导小组，负责领导、协调合并工作的具体实施。
八、有关两校合并工作的具体安排及其他未尽事项，由教育部、上海市人民政府按此原则意见共同协商确定。
附：关于上海交通大学与上海第二医科大学合并的工作备忘
教育部
上海市人民政府
二00五年六月日
附：
关于上海交通大学与上海第二医科大学合并的工作备忘
为落实教育部和上海市人民政府关于上海交通大学和上海第二医科大学合并的意见，经共同协商，拟订以下工作备忘：
一、建立两校合并工作领导小组。教育部由张保庆、吴启迪副部长，上海市由殷一璀副书记、严隽琪副市长为负责人，组成由教育部有关司局和上海市政府有关部门负责同志参加的领导小组。下设具体工作班子，即两校合并工作筹备小组，成员由上海交通大学和上海第二医科大学党政主要领导组成，上海市科教党委和上海市教委派分管领导协助工作。
二、成立上海交通大学医学院理事会。教育部和上海市政府有关部门以及上海交通大学、原上海第二医科大学等负责人为理事会成员。理事长和副理事长由教育部、上海市政府和上海交通大学委派，新组建的上海交通大学医学院院长任执行副理事长。理事会每年召开一到两次会议，根据上海交通大学统一发展规划，研究决定与共建上海交通大学医学院相关的重要事项，包括办学方向、发展规划、招生计划、教学科研和年度经费使用计划，以及重大改革措施等。
