省卫生厅对第一类疫苗预防接种异常反应补偿资金实行专账管理。
第十一条 省财政厅每年据省卫生厅的申请将预防接种异常反应补偿专项经费划拨到省卫生厅账户，由省卫生厅负责专项经费管理，实行专账核算，每年结算一次，结余的专项经费结转下一年度使用，不足部分在省财政下年度划拨的预防接种异常反应补偿专项经费中支出。
第十二条 因预防接种异常反应要求补偿的，受种者或其监护人、法定继承人应在收到预防接种异常反应诊断书或预防接种异常反应鉴定书之日起90日内，凭身份证或户口本、预防接种异常反应调查诊断书和预防接种异常反应伤残程度等级鉴定结论或预防接种异常反应鉴定书等原件，向当地县级卫生行政部门提出补偿申请并填写《广东省预防接种异常反应补偿申请书》（下称“申请书”），逾期不予受理。
第十三条 县级卫生行政部门受理预防接种异常反应补偿申请后，在15个工作日内负责审核、核算补偿金额并加具意见，上报所在地的地级以上市卫生行政部门审核。
地级以上市卫生行政部门在收到县级卫生行政部门审核意见后15个工作日内审核，并将审核结果上报省卫生厅审核认定。
省卫生厅应当在收到地级以上市卫生行政部门复审意见后，在20个工作日内审核认定并将结果送达地级以上市卫生行政部门，并抄送省财政厅。
地级以上市卫生行政部门收到审核认定结果后，在7个工作日内将审核结果送达县级卫生行政部门。
第十四条 县级卫生行政部门收到省卫生厅的审核结果认定后，在7个工作日内通知受种者或者其法定监护人、法定继承人签订补偿协议书。协议书应明确预防接种基本情况、预防接种异常反应调查诊断或鉴定结论、伤残程度等级、补偿金额、补偿费用收款人账户（收款人为受种人或者其法定监护人、法定继承人）和为及时救治患者而先行垫支相关费用的单位账户号和金额，责任和义务，并由受种者或者其法定监护人、法定继承人在协议书上签名。预防接种异常反应发生后为及时治疗患者，相关单位垫支的费用应在一次性补偿费中扣除。
第十五条 县级卫生行政部门与受种者或者其法定监护人、法定继承人签订补偿协议书后，7个工作日内将补偿协议书报送地级以上市卫生行政部门。
